8月28日，深圳第叁人民医院（南方科技大学第贰附属医院）／深圳国家感染性疾病临床医学研究中心卢洪洲/刘映霞/杨扬教授团队在Nature Communications杂志（IF：14.7）在线发表了题为“Evolutionary trajectory and characteristics of Mpox virus in 2023 based on a large-scale genomic surveillance in Shenzhen, China”的研究论文，系统揭示了猴痘病毒CladeIIb的进化轨迹和特征，第壹次鉴定了新的C.1.1谱系，说明了深圳地区流行的猴痘病毒可能来源。

　　值得注意的是，世卫组织数据显示，今年以来报告猴痘病例数超过1.56万例，已超过去年病例总数，其中去世病例达537例。

　　猴痘疫情为国际关注的突发公共卫生事件

　　1958年猴痘病毒第壹次被分离自发烧的猕猴体内，1970年在刚果第壹次报道感染人感染病例。2021年之前，猴痘病毒主要流行区域一直局限于中非和西非国家，这些地区偶发的猴痘疫情通常与感染动物的直接接触有关。

　　据记者了解，2022年5月份以来，猴痘病毒波及全球的121个国家和地区流行，截至2024年7月31日，已累计确诊超过10万例。自1980年WHO宣布天花病毒被人类完全灭绝之后，猴痘病毒已成为全球公共卫生领域要挟最大的正痘病毒。

　　猴痘病毒可以分为两个主要分支，Clade I 的猴痘病毒造成的患病情况较重，病死率可达10.6%；而Clade II 猴痘的病发症状较轻，全球病死率约为0.22%。近期非洲疾控中心报道了自2024年以来，非洲地区新增了14,250例猴痘患者，较去年同期激增160%。

　　WHO提示Clade I分支已经演化出Clade Ib分支，并在非洲大规模流传。8月14日，WHO再次宣布猴痘疫情为国际关注的突发公共卫生事件。

　　猴痘病毒通过性接触流传的危险较高

　　自2023年6月以来，深圳地区开始出现猴痘病毒的持续本土流行。深圳第叁人民医院（南方科技大学第贰附属医院）研究团队迅速建立了临床研究队列，并入了92例猴痘感染患者，通过全基因组扩增测序获得了92个高质量的MPXV全基因组序列，进一步结合系统进化分析说明了深圳地区流行的猴痘病毒可能来源，说明了猴痘病毒CladeIIb的进化路径和特征。

　　据了解，本次研究并入了92例病例，分别占 广东省 和深圳同期报告病例数的30%和66%。人口学特征显示，所有患者均为男性，中位年龄为30岁，56.5%的病患同时确诊了人类免疫缺陷病毒(HIV)。流行病学调查显示，其中95.7%存在男男性行为（MSM）。患者全身多个部位均有皮肤病变，62.2%的病患有生殖器病变，提示猴痘病毒通过性接触流传的危险较高。

　　深圳地区的猴痘病毒可能有3个不同来源地

　　系统发育分析结果显示，92株深圳MPXV都位于谱系C.1内，除2022年重庆第壹次报道的毒株外，2023年中国测序的其它4株猴痘病毒也均属于C.1谱系。基因组进化关系提示深圳地区的猴痘病毒可能有3个不同来源地（韩国、日本和葡萄牙）。尽管仅有2对患者报告了流行病学关联，可是全基因组系统进化分析显示深圳地区猴痘病毒基因组聚集成簇，提示猴痘病毒在深圳地区MSM人群中已经建立了至少2个稳定的流传链。

　　通过对MPXV进化树中的C.1谱系的进一步分析，研究团队发现，C.1谱系从流行地域和流行时间可以进一步分为2个不一样的亚谱系：C.1和C.1.1。其中，C.1谱系的流行区域主要在亚洲，包含日本、韩国、印尼和中国。此次深圳猴痘病毒中有4例属于C.1分支，前期文献报道的中国北京和杭州的2例猴痘病毒也属于此谱系。同时，C.1谱系的主要流行时间从2022年9月至2023年6月。而C.1.1谱系主要流行于欧洲的葡萄牙和爱尔兰和中国深圳、北京、云南地区，此次研究团队报道的深圳猴痘病毒大部分属于C.1.1谱系。

　　研究显示，从时间上看，C.1.1谱系病毒的流行时间聚焦在2024年的6-10月，CladeIIb猴痘病毒核苷酸突变图谱的聚类结果与系统发育树中的谱系分类结果一致，进一步支持了系统发育关系的稳定性和新谱系C.1.1的出现。

　　值得注意的是，本研究第壹次揭示了在C.1.1谱系中出现的C21062T突变造成N2L基因的转录起始中断。N2L基因的突变已经被证明可以降低痘苗病毒的毒力，因而其也有可能影响猴痘病毒C.1.1谱系的毒力与适应性。

　　这些结果表明，MPXV在其持续进化进程中积累了与毒力和表面抗原蛋白相关的突变，需要对其致病性和流传性的潜在变化保持戒备。